La comptabilité est toujours garante de la santé financière d’une entreprise. C’est pourquoi il est essentiel d’avoir une solution de gestion financière adaptée à vos besoins. De plus en plus d’entreprises ont compris l’importance d’une comptabilité automatique en ligne performante. En effet, un bon logiciel de gestion comptable permet de réduire les erreurs ou d’accélérer le traitement des différentes données. Vous souhaitez gagner du temps et améliorer la gestion quotidienne et stratégique de votre entreprise ? Analyse des enjeux d’un bon logiciel de comptabilité pour améliorer le quotidien d’une entreprise.
Les 14 meilleurs logiciels de gestion comptable
Il existe sur le marché un nombre infini de logiciels de gestion comptable. Pour vous aider, nos experts Apogea, intégrateur Sage, ont réuni le top 14 des meilleurs logiciels de gestion comptable du marché. Grâce à notre expertise en tant qu’intégrateur Sage, nous vous accompagnons dans le choix et l’implémentation de la solution la plus adaptée à vos besoins. Ainsi, vous aurez plus de facilité à sélectionner le logiciel qui sera en total accord avec les exigences de votre entreprise.
Sage 100 comptabilité
Gagnez du temps grâce à des processus automatisés dans Sage 100 Comptabilité. Suivez vos principaux indicateurs en temps réel : chiffre d’affaires, rentabilité…
Sage 100 Comptabilité propose une gestion complète des opérations comptables, y compris la saisie des écritures, la gestion des comptes clients et fournisseurs, et la génération des états financiers.
- Automatisation des écritures comptables.
- Gestion des factures et des paiements
- Réconciliation bancaire automatisée
- Reporting financier détaillé

Sage 100 Comptabilité propose une gestion complète des opérations comptables, y compris la saisie des écritures, la gestion des comptes clients et fournisseurs, et la génération des états financiers.
Sage FRP 1000 Comptabilité

Avec Sage FRP 1000 comptabilité, réduisez le temps de traitement des tâches redondantes, automatisez vos processus comptables et simplifiez le travail de votre service financier au quotidien !
Ce logiciel offre une vision complète et précise des finances, permettant un contrôle et une analyse financière améliorés.
- Consolidation financière : Outils puissants pour la consolidation de rapports financiers de plusieurs entités.
- Gestion de la trésorerie : Outils avancés pour optimiser la gestion de la liquidité et des prévisions financières.
- Intégration ERP : S'intègre avec d'autres modules Sage pour une gestion globale efficace.
Sage FRP 1000 Comptabilité s’adresse aux entreprises qui ont besoin d’une solution comptable puissante et adaptable pour gérer des opérations complexes.
Le logiciel de gestion comptable Quickbooks
Quickbooks est un logiciel de comptabilité 100% en ligne recommandé pour les TPE/PME, adapté à la comptabilité française. Le logiciel donne accès à de nombreuses fonctionnalités : la facturation : vous personnalisez, créez et envoyez vos devis, factures, avoirs, reçus de vente ou bons de commande.
Fonctionnalités
Intuit QuickBooks s’impose comme l’un des logiciels de comptabilité les plus populaires auprès des petites entreprises, et ce, pour plusieurs raisons. Il allie simplicité d’utilisation et richesse fonctionnelle, ce qui en fait une solution idéale pour les entrepreneurs, indépendants et TPE souhaitant gérer leurs finances efficacement, sans expertise comptable avancée.
- Suivi des ventes et des dépenses
- Facturation et gestion des paiements
- Réconciliation bancaire automatisée
- Reporting financier en temps réel
Ce logiciel comptable pme en ligne possède de nombreux avantages : ergonomique, intuitif, tableaux de bord complets, nombre d’utilisateurs illimité et plus de 160 devises.
Pennylane, le nouveau logiciel comptable en vogue
Pennylane rassemble tous les outils et toutes les intégrations nécessaires pour gérer l’ensemble de vos dépenses, votre facturation, votre trésorerie ainsi que votre comptabilité.
- Facturation des clients et fournisseurs
- Pilotage de votre trésorerie en quelques clics
- Conforme à la réforme de la facture électronique
- Gestion globale de votre comptabilité d'entreprise
Opter pour Pennylane, c’est faire le choix d’une solution comptable et financière moderne, pensée pour répondre aux besoins des entrepreneurs, TPE et PME. En tant que logiciel 100% français, Pennylane garantit une conformité totale aux réglementations locales et une parfaite compréhension des enjeux des entreprises françaises.

Focus sur la norme comptable ANC
L’entrée en vigueur, le 1er janvier 2025, du règlement de modernisation des états financiers va imposer aux entreprises françaises de nombreuses modifications dans la présentation de leurs comptes.
Cette évolution vise à simplifier et clarifier les normes comptables, en améliorant transparence et fiabilité ! Découvrez les objectifs et les avantages de cette réforme dans notre article dédié.
Sage Business Cloud Comptabilité
Dites adieu aux fichiers Excel et opérations manuelles pour la gestion de vos données comptables et accélérez votre processus de tenue comptable avec le logiciel Sage Business Cloud Comptabilité.
- Gestion des factures et des paiements : Automatisation de l'émission des factures et du suivi des paiements.
- Reporting financier : Rapports personnalisables pour une vision claire de la santé financière.
- Intégration : S'intègre avec d'autres applications Sage pour une gestion d'entreprise complète.
En somme, Sage Business Cloud Comptabilité est la solution idéale pour les PME souhaitant moderniser leur gestion financière sans complexité excessive.

EBP Comptabilité
EBP Comptabilité est un logiciel de gestion comptable destiné aux TPE et PME. Il permet de simplifier les tâches comptables quotidiennes comme la saisie des écritures, la gestion de la TVA, et la préparation du bilan et du compte de résultat. EBP est une solution de comptabilité en ligne adaptée aux petites et moyennes entreprises, connue pour sa simplicité et son efficacité.
- Automatisation des écritures comptables
- Gestion des factures et des paiements
- Réconciliation bancaire
- Outils de reporting financier
Personnalisable, EBP Compta évolue en fonction des besoins de l’entrepreneur. Il peut être utilisé pour la gestion quotidienne de l’entreprise
Le logiciel comptable lyonnais : CEGID
Cegid est largement utilisé en France et dans d’autres pays francophones, et il est connu pour son engagement envers l’innovation technologique et la conformité aux normes comptables et fiscales locales. Le choix d’une solution Cegid dépendra des besoins spécifiques de votre entreprise et de la juridiction dans laquelle vous opérez.
- Gestion fiscale et sociale : Outils spécifiques pour la gestion de la fiscalité et des déclarations sociales.
- Analyse financière détaillée : Outils d'analyse et de reporting pour une meilleure prise de décision.
- Intégration avec d'autres logiciels : Peut être couplé avec d'autres solutions CEGID ou tierces pour une gestion intégrée.
CEGID est la réponse idéale pour les entreprises recherchant une solution comptable performante, conforme aux exigences françaises et intégrant une gestion efficace de la comptabilité de gestion.
L'ERP Finance de Microsoft Dynamics 365
Ce module offre des fonctionnalités avancées pour la préparation de rapports financiers précis, l’analyse financière, ainsi que le suivi et la prévision des flux de trésorerie. Grâce à son intégration fluide avec les autres modules de Business Central, il permet une vue d’ensemble et en temps réel des finances, favorisant une prise de décision éclairée et stratégique.
- Automatisation des processus : Réduit le temps consacré aux tâches manuelles grâce à l'automatisation des processus financiers.
- Gestion du risque : Outils avancés pour la gestion et l'analyse des risques financiers.
- Compliance : Assure la conformité aux normes internationales et locales avec des mises à jour régulières.
L’ERP Finance de Microsoft Dynamics 365 est idéal pour les entreprises cherchant à intégrer et à moderniser leur gestion financière dans un environnement évolutif.
Le logiciel Indy
Indy est une solution comptable pensée spécifiquement pour les indépendants, freelances et auto-entrepreneurs. Son objectif ? Simplifier et automatiser la gestion comptable afin que vous puissiez vous concentrer sur votre activité principale sans vous soucier des contraintes administratives.
- Catégorisation automatique des transactions : Les dépenses et recettes sont triées de manière intelligente pour un suivi structuré et clair.
- Déclarations fiscales et TVA automatisées : Plus besoin de passer des heures sur vos obligations fiscales, Indy s’en occupe pour vous.
- Interface ergonomique et intuitive : Pensée pour les non-experts, elle offre une expérience fluide et agréable.
- Synchronisation bancaire en temps réel : Suivez l’évolution de votre trésorerie sans effort.
- Un tarif accessible et adapté aux petites structures : Indy propose une version gratuite pour la gestion comptable et une offre premium à 12€/mois pour les déclarations et bilans.
Grâce à une interface intuitive et une automatisation avancée, Indy prend en charge les principales tâches comptables, telles que la saisie des opérations, la déclaration fiscale et la gestion de la facturation
Le logiciel SAP
SAP (Systems, Applications and Products in Data Processing) est une référence incontournable dans le domaine des logiciels ERP (Enterprise Resource Planning). Conçu par une entreprise allemande, SAP propose une gamme complète de solutions adaptées aux besoins des entreprises de toutes tailles et de tous secteurs.
- Élimination des redondances et des incohérences : Toutes les données sont enregistrées et mises à jour en temps réel, garantissant une information fiable et uniforme à travers les différents services de l’entreprise.
- Amélioration de la collaboration interne : Grâce à une base de données centralisée, les informations sont partagées instantanément entre les différents départements.
- Compatibilité avec plusieurs systèmes d’exploitation : SAP fonctionne sur Linux, Windows, Solaris et Unix, garantissant une grande flexibilité d’intégration.
- Intégration avec Mooncard : SAP est compatible avec cette solution de gestion des dépenses professionnelles, facilitant encore davantage le suivi financier.
Grâce à sa standardisation et son uniformisation des processus métiers, SAP s’impose comme une solution idéale pour les entreprises cherchant à rationaliser leur gestion financière et comptable.
Le logiciel Quadratus
Quadratus est un logiciel de gestion tout-en-un spécialement conçu pour répondre aux besoins des TPE, PME et associations. Développé par Cegid, il s’articule autour de quatre modules principaux : la comptabilité, la gestion commerciale, le CRM (gestion de la relation client) et la gestion des ressources humaines.
- Comptabilité générale : Gestion des écritures comptables, suivi des flux financiers
- Numérisation des pièces comptables : Saisie simplifiée des achats, ventes, encaissements et décaissements.
- Automatisation des opérations bancaires : Importation automatique des relevés bancaires, gestion des prélèvements et lettrage des transactions.
- Déclaration fiscale : Intégration des déclarations de TVA et autres obligations comptables.
Grâce à une interface intuitive et une automatisation avancée, Indy prend en charge les principales tâches comptables, telles que la saisie des opérations, la déclaration fiscale et la gestion de la facturation
Le logiciel Divalto Infinity
Divalto Infinity est un logiciel ERP et CRM français conçu pour répondre aux besoins des PME et des ETI. Modulaire, complet et hautement personnalisable, il offre une solution moderne pour optimiser la gestion d’entreprise. Grâce à ses nombreuses fonctionnalités, il s’adapte à différents métiers et secteurs d’activité, garantissant ainsi une meilleure productivité et une gestion centralisée des opérations.
- Comptabilité et finances : suivi budgétaire, déclaration de TVA, gestion des immobilisations, génération automatisée de la liasse fiscale, import/export des données comptables, outils analytiques, gestion des règlements et des relances, saisie comptable et gestion de la trésorerie.
- Gestion commerciale : suivi des ventes, devis, facturation et gestion des stocks
- Gestion à l’affaire et qualité : traçabilité des projets et optimisation des processus.
- Gestion à l’affaire et qualité : traçabilité des projets et optimisation des processus.
Divalto Infinity se positionne comme une solution ERP et CRM performante et accessible. Son modèle de tarification démarre à 29 € HT/mois, offrant ainsi un excellent rapport qualité-prix pour les PME et ETI souhaitant moderniser leur gestion d’entreprise.
Xero
Créé en 2006, Xero s’est imposé comme une référence dans le domaine de la comptabilité en ligne, avec plusieurs millions d’utilisateurs à travers le monde. Grâce à son architecture 100% Cloud, il permet aux petites entreprises de gérer leur comptabilité en toute mobilité, sans contrainte d’installation et avec un accès sécurisé depuis n’importe quel appareil connecté.
- Comptabilité analytique : suivi précis des coûts et des performances financières.
- Configuration et installation simplifiées : mise en place rapide sans compétences techniques avancées.
- Tenue de livres : gestion des écritures comptables, rapprochement bancaire et suivi des transactions en temps réel.
Xero propose une tarification adaptée aux besoins des petites entreprises, avec des abonnements allant de 20 à 40 $/mois, accompagnés d’un essai gratuit de 30 jours pour tester l’outil sans engagement.
Grâce à sa flexibilité, ses nombreuses fonctionnalités et son accessibilité, Xero s’impose comme une solution incontournable pour les entrepreneurs et PME souhaitant simplifier leur gestion comptable tout en bénéficiant des avantages du Cloud.
Kiwili : L’application comptable tout-en-un pour les petites entreprises
Kiwili est bien plus qu’un simple logiciel comptable : c’est une solution de gestion complète pensée pour faciliter la vie des entrepreneurs individuels et des petites entreprises. Lancée en 2007 au Canada par une équipe passionnée, la plateforme ne cesse d’évoluer pour offrir des outils performants et adaptés aux besoins des entreprises modernes.
- Comptabilité : suivi financier, rapprochement bancaire et gestion des transactions.
- Facturation et devis : création et envoi automatisé, suivi des paiements clients.
- Gestion de projets : suivi des tâches, collaboration en équipe et gestion des échéances.
- Gestion du temps : suivi des heures travaillées et des ressources affectées aux projets.
Choisir Kiwili, c’est opter pour un outil de gestion puissant, flexible et accessible, qui accompagne les petites entreprises et les indépendants dans leur développement. Grâce à ses fonctionnalités évolutives et son approche centrée sur l’utilisateur, Kiwili s’impose comme une solution incontournable pour gérer efficacement son activité.