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Mis à jour en 2025
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Logiciels comptabilité Saas : notre sélection des meilleurs logiciels

Avec l’essor des solutions Software as a Service (SaaS), les logiciels de comptabilité en ligne se sont imposés comme des outils incontournables pour les entreprises cherchant à optimiser leur gestion financière. Ces logiciels offrent des fonctionnalités variées, telles que l’automatisation des tâches, une accessibilité en temps réel, et des outils de conformité avec la législation.

 

Voici un guide détaillé des meilleurs logiciels de comptabilité SaaS disponibles sur le marché. Dans cet article, nous vous présentons une sélection des meilleures solutions SaaS de comptabilité, adaptées aux besoins des TPE, PME, et startups, pour vous accompagner dans le choix de l’outil le plus pertinent pour votre activité.

 

Pour vous aider à identifier la solution la plus adaptée à votre organisation, nous vous proposons un guide complet des meilleurs logiciels de comptabilité SaaS du marché.

Ces solutions se distinguent notamment par :

Découvrez dès maintenant notre sélection des solutions les plus performantes pour optimiser votre gestion comptable au quotidien.

 

En 2025, les logiciels comptables se réinventent autour de l’automatisation, de la collaboration et de l’analyse en temps réel. Entre solutions tout-en-un, outils spécialisés pour les TPE et plateformes évolutives pour les PME, le marché offre aujourd’hui une diversité inédite.

 

Pourtant, cette richesse rend le choix du bon outil plus complexe que jamais : quelle solution répond vraiment à vos besoins métiers, à vos obligations légales et à votre organisation comptable ?

 

C’est pourquoi notre comparatif 2025 des meilleurs logiciels de comptabilité, élaboré par les consultants experts d’Apogea, vous propose une analyse claire, objective et fondée sur l’expérience terrain.

SOMMAIRE

Sage Intacct : L’ERP financier qui vous offre un pilotage à 360° pour une gestion plus fluide et des décisions plus éclairées

Sage Intacct est un ERP financier cloud conçu pour offrir aux entreprises une gestion comptable et financière optimisée, avec une vision à 360° sur leur activité. Grâce à son interface intuitive, son automatisation avancée et ses capacités analytiques puissantes, il permet de gagner en efficacité, d’améliorer la visibilité sur la performance financière et de prendre des décisions éclairées en temps réel.

Avantages

Sage Intacct se distingue par ses fonctionnalités avancées et ses nombreux avantages, offrant aux PME et MGE un outil fiable pour optimiser leur gestion financière et faciliter des prises de décision plus éclairées.

Capture d’écran de l’interface Sage Intacct

Fonctionnalités

Avec ses fonctionnalités puissantes et intuitives, Sage Intacct permet aux entreprises de piloter efficacement leur gestion financière, d’automatiser les processus clés et d’optimiser leur prise de décision.

Grâce à ses fonctionnalités avancées, son automatisation intelligente et sa capacité à offrir une vue en temps réel sur la performance financière, Sage Intacct s’impose comme un outil incontournable pour les entreprises souhaitant optimiser leur gestion et gagner en agilité. Avec cet ERP cloud, la prise de décision devient plus rapide, plus précise et plus stratégique ! 🚀

Pennylane : le logiciel de comptabiltié tout-en-un qui réunit votre comptabilité, vos finances et votre compte pro

Pennylane n’est pas qu’un simple logiciel et application comptable ; c’est une plateforme SaaS “tout-en-un” spécialement conçue pour répondre aux besoins évolutifs des PME et des startups. Son principal atout réside dans sa capacité à centraliser la comptabilité, la gestion financière et les opérations quotidiennes sur une seule interface intuitive et performante. Cette centralisation permet de gagner un temps précieux tout en offrant une vue globale et actualisée des finances de l’entreprise.

Avantages

L’un des principaux atouts de Pennylane est sa vision globale de la comptabilité et de la finance d’entreprise. Cette solution simplifie les interactions entre les comptables, les gestionnaires financiers et les dirigeants, en offrant une vue unifiée des finances de l’entreprise.

Capture d’écran de l’interface Pennylane

Fonctionnalités

Pennylane propose un ensemble de fonctionnalités avancées qui permettent de suivre, d’analyser et de gérer tous les aspects financiers d’une entreprise, avec un accent particulier sur l’automatisation et la simplification des processus.

Pennylane est une solution innovante pour les PME et startups qui souhaitent simplifier leur gestion comptable tout en ayant une vision claire de leurs finances en temps réel. Sa capacité à centraliser les données comptables et financières en fait un choix judicieux pour les entreprises en quête de performance et de transparence​

Sage 100 Comptabilité : la solution de gestion pensée pour les PME qui veulent gagner en précision et en efficacité

Sage 100 Comptabilité est une solution de gestion financière complète destinée aux entreprises de taille moyenne. Ce logiciel SaaS offre des fonctionnalités avancées pour la gestion comptable, permettant aux entreprises de gérer efficacement leurs finances, leurs flux de trésorerie et de respecter les obligations fiscales. Sage 100 est une solution modulable, offrant une compatibilité avec d’autres outils de gestion de la suite Sage.

Avantages

Sage 100 Comptabilité est particulièrement apprécié des PME, car il permet de gérer des volumes importants de données financières tout en offrant des fonctionnalités avancées adaptées à leurs besoins.

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Capture d’écran de l’interface Sage 100 comptabilité

Fonctionnalités

Les fonctionnalités proposées par Sage 100 Comptabilité, logiciel de comptabilité Saas, couvrent l’ensemble des besoins comptables des entreprises de taille moyenne, avec des outils qui facilitent l’automatisation des tâches courantes.

Sage 100 Comptabilité est bien plus qu’un simple logiciel de gestion comptable ; c’est un outil stratégique conçu pour répondre aux besoins complexes des entreprises de taille moyenne. Sa flexibilité, ses fonctionnalités avancées, et sa sécurité en font un allié incontournable pour optimiser la gestion financière, accompagner la croissance, et assurer la conformité en toute sérénité.

Sage Business Cloud Comptabilité : simplifiez votre gestion financière avec une solution cloud accessible et intuitive

Sage Business Cloud Comptabilité est un logiciel SaaS conçu pour simplifier la gestion financière des petites et moyennes entreprises (PME). Grâce à une interface intuitive et des outils puissants, il permet de gérer les opérations comptables, de la facturation à la tenue des comptes, tout en assurant une conformité avec les normes fiscales. Sa flexibilité et sa compatibilité avec d’autres outils Sage en font une solution idéale pour les entreprises en croissance.

Avantages

Sage Business Cloud Comptabilité se distingue par ses fonctionnalités complètes et sa capacité à simplifier les processus financiers pour les PME. En plus d’offrir une gestion centralisée des opérations financières, ce logiciel propose des outils de reporting avancés.

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Capture d’écran de l’interface Sage Businesd Cloud Comptabilité

Fonctionnalités

Ce logiciel se distingue par une gamme étendue et complète de fonctionnalités, conçue pour répondre aux différents aspects de la gestion financière des entreprises, qu’elles soient de petite, moyenne ou grande taille. En combinant une approche fluide et structurée, il permet de centraliser et d’optimiser les processus financiers, garantissant ainsi un gain de temps et une réduction significative des erreurs humaines.

Sage Business Cloud Comptabilité est une solution complète, intuitive et évolutive qui répond aux enjeux des DAF. En offrant une gestion financière optimisée, une collaboration simplifiée, et une conformité garantie, il se positionne comme un outil stratégique pour améliorer la performance, gagner en efficacité, et accompagner la croissance des entreprises.

EBP Comptabilité : le logiciel flexible qui accompagne les TPE/PME dans une gestion comptable maîtrisée

EBP Comptabilité est un logiciel SaaS conçu pour répondre aux besoins des petites et moyennes entreprises, ainsi que des indépendants. Il offre une interface simple et conviviale qui permet de gérer facilement la comptabilité de l’entreprise. Avec des fonctionnalités de base telles que la facturation, le suivi des dépenses et la déclaration fiscale, EBP est une solution abordable pour ceux qui recherchent une gestion financière simplifiée.

Avantages

EBP Comptabilité est particulièrement adapté aux TPE et PME qui souhaitent s’équiper d’un logiciel de comptabilité en ligne facile à utiliser, mais offrant les fonctionnalités essentielles pour une gestion comptable efficace.

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Capture d’écran de l’interface EBP comptabilité

Fonctionnalités

Bien qu’il soit conçu avec une simplicité d’utilisation en tête, EBP Comptabilité ne sacrifie pas la richesse fonctionnelle nécessaire pour gérer les finances d’une petite entreprise. Ce logiciel offre une solution adaptée aux TPE (Très Petites Entreprises) et aux entrepreneurs individuels, combinant une interface intuitive avec des outils essentiels pour garantir une gestion financière fluide et efficace.

EBP Comptabilité est un logiciel de comptabilité en ligne pour les petites entreprises et indépendants qui recherchent une solution fiable et économique. Sa facilité d’utilisation, sa couverture complète des besoins comptables, et son support client de qualité en font un choix idéal pour gérer les finances en toute sérénité. Avec EBP Comptabilité, les petites structures peuvent optimiser leur gestion financière sans complexité ni frais excessifs, tout en ayant la garantie d’un outil conforme et évolutif.

Ciel Comptabilité : une solution simple et efficace pour piloter facilement la comptabilité de votre petite entreprise

Ciel Comptabilité est un logiciel comptable SaaS développée par Sage, spécialement conçue pour les petites entreprises et les indépendants. Ce logiciel propose une gestion simplifiée de la comptabilité tout en permettant de rester conforme aux exigences fiscales françaises. Ciel Comptabilité est un choix populaire parmi les TPE et micro-entrepreneurs, grâce à sa facilité d’utilisation et son coût accessible.

Avantages

Ciel Comptabilité se distingue par son approche intuitive et son adaptation aux besoins des petites entreprises, qui n’ont pas toujours besoin d’outils comptables complexes.

Fonctionnalités

Ciel Comptabilité se démarque par son éventail de fonctionnalités pratiques, conçu pour rendre les tâches comptables accessibles et efficaces, même pour les entrepreneurs avec peu ou pas d’expérience en gestion financière. Ce logiciel répond spécifiquement aux besoins des micro-entreprises, TPE et travailleurs indépendants, en leur fournissant des outils qui allient simplicité d’utilisation et performances fonctionnelles.

Ciel Comptabilité est plus qu’un simple logiciel : c’est un allié stratégique pour les petites entreprises et les travailleurs indépendants. Sa simplicité, son coût abordable, et sa conformité avec les réglementations fiscales en font un choix judicieux pour ceux qui cherchent une solution fiable, intuitive, et adaptée à leurs besoins spécifiques. Il permet aux entrepreneurs de gérer leur comptabilité en toute autonomie, tout en assurant un suivi rigoureux et sécurisé de leurs finances.

QuickBooks Comptabilité : l’outil en ligne qui aide les entrepreneurs à suivre leurs finances en toute simplicité

QuickBooks Comptabilité est un logiciel SaaS très prisé à l’international, particulièrement adapté aux petites et moyennes entreprises ainsi qu’aux startups. Développé par Intuit, QuickBooks est connu pour sa facilité d’utilisation, sa flexibilité et ses nombreuses intégrations avec d’autres outils de gestion. En tant que solution de comptabilité cloud, il permet de gérer la comptabilité, la facturation, les paiements et le suivi des finances à partir d’une plateforme unique.

Avantages

QuickBooks offre une approche flexible et complète de la gestion comptable, avec des fonctionnalités qui répondent aux besoins variés des entreprises en pleine croissance.

Capture d’écran de l’interface QuickBooks

Fonctionnalités

QuickBooks Comptabilité est bien plus qu’un simple logiciel  de comptabilité SaaS : il s’agit d’un véritable outil stratégique pour les entreprises souhaitant automatiser leurs processus financiers, gagner en efficacité, et maintenir une vue globale et claire de leur situation économique. Grâce à une large gamme de fonctionnalités, il répond aussi bien aux besoins des petites et moyennes entreprises qu’à ceux des startups en quête d’outils performants et flexibles.

QuickBooks Comptabilité n’est pas seulement un outil de gestion financière ; c’est un partenaire stratégique qui aide les entreprises à automatiser leurs processus, optimiser leur efficacité, et maintenir une vision claire et en temps réel de leur situation financière. Sa large gamme de fonctionnalités, sa facilité d’intégration avec d’autres outils, et son accessibilité depuis le cloud en font un choix idéal pour les entreprises en quête d’un logiciel performant, évolutif, et adapté à leurs besoins. De plus, QuickBooks Comptabilité permet de se conformer facilement à des exigences réglementaires, telles que la norme comptable ANC, garantissant ainsi une gestion financière conforme et rigoureuse.

SAP Comptabilité : la plateforme robuste pour les entreprises qui recherchent performance et pilotage avancé

SAP (Systems, Applications and Products in Data Processing) est une entreprise allemande proposant un PGI complet composé de modules adaptés à chaque secteur d’activité. Pour les TPE et PME, le module comptable SAP Financial and Costing permet de gérer l’ensemble des écritures de ventes et d’achats, automatiquement intégrées en comptabilité générale, analytique, client et fournisseur.

Avantages

SAP propose une solution ERP robuste et adaptable, offrant des fonctionnalités avancées pour optimiser la gestion comptable et financière des entreprises.

Fonctionnalités

Grâce à ses outils de pilotage en temps réel et son interopérabilité avec d’autres systèmes, SAP offre une vision précise et instantanée des performances financières. Avec ses fonctionnalités complètes et son interopérabilité, SAP simplifie la gestion comptable tout en garantissant un suivi précis et sécurisé des finances.

SAP est une solution puissante qui optimise la gestion comptable et financière grâce à ses fonctionnalités avancées. En automatisant les processus et en centralisant les données, il permet aux entreprises de gagner en efficacité et en fiabilité. Son interopérabilité et son pilotage en temps réel en font un outil incontournable pour une gestion fluide et performante.

Quadratus Comptabilité : la solution SaaS qui optimise votre gestion comptable en toute flexibilité

Quadratus est un logiciel de gestion comptable et financière conçu pour répondre aux besoins des TPE, PME et cabinets comptables. Grâce à son interface intuitive et ses fonctionnalités avancées, il facilite la gestion des écritures, l’analyse financière et l’automatisation des tâches comptables.

Avantages

SAP propose une solution ERP robuste et adaptable, offrant des fonctionnalités avancées pour optimiser la gestion comptable et financière des entreprises.

Fonctionnalités

Quadratus se distingue par ses nombreux atouts qui facilitent la gestion comptable et financière des entreprises. Son ergonomie, son automatisation des tâches et sa conformité aux normes comptables en font une solution efficace et adaptée aux professionnels.

Grâce à ses fonctionnalités complètes et intuitives, Quadratus permet aux entreprises d’optimiser leur gestion comptable tout en garantissant fiabilité et conformité. Son interopérabilité et sa capacité d’automatisation en font un outil performant, adapté aux besoins des professionnels.

Divalto Infinity : l’ERP complet pour accompagner la performance et la croissance des PME

Le logiciel français Divalto Infinity propose une large gamme de fonctionnalités réparties en modules spécialisés : comptabilité et finances, gestion commerciale, paie-RH, gestion à l’affaire, qualité, GPAO pour les industriels, GMAO, GRM pour la gestion des équipements, WMS pour l’optimisation des entrepôts, ainsi que le pilotage du système de management de la qualité (SMQ). Pour les TPE et PME, l’intérêt se porte particulièrement sur le module comptabilité et finances, qui répond à leurs besoins quotidiens de gestion financière.

Avantages

SAP propose une solution ERP robuste et adaptable, offrant des fonctionnalités avancées pour optimiser la gestion comptable et financière des entreprises.

Fonctionnalités

Le module Comptabilité et Finances de Divalto Infinity offre une gestion complète et automatisée des opérations comptables, garantissant fiabilité et conformité aux normes en vigueur. 

Divalto Infinity se positionne comme une solution complète et évolutive, offrant une gestion comptable et financière optimisée pour les entreprises de toutes tailles. Grâce à ses fonctionnalités avancées et son interopérabilité, il permet d’automatiser les processus, d’assurer la conformité aux normes et de faciliter la prise de décision. Un outil puissant et fiable pour piloter efficacement la comptabilité et la finance.

Notre synthèse des meilleurs logiciels de comptabilité Saas sur le marché en 2025
Tableau Comparatif des Logiciels de Gestion Comptable
LogicielCibleIntégration avec d'autres solutionsTarification
Sage IntacctETI et grandes entreprises recherchant une solution cloud financière avancéeIntégration avec diverses solutions ERP et CRMTarification personnalisée selon les besoins de l'entreprise
PennylaneTPE et PME souhaitant centraliser leur gestion comptable et financièreIntégration avec de nombreux outils métiers via APIAbonnement mensuel selon les fonctionnalités
Sage 100 ComptabilitéPME cherchant une solution complète et robusteIntégration avec d'autres solutions Sage et outils tiersTarification sur devis selon les modules et utilisateurs
Sage Business Cloud ComptabilitéTPE/PME souhaitant une solution 100% cloud simple et mobileIntégration avec diverses applications cloud et services bancairesTarification sur demande
EBP ComptabilitéTPE/PME recherchant une solution de compta accessible et modulableIntégration avec les solutions EBP et d'autres outils via APITarification sur devis selon les modules choisis
Ciel ComptabilitéArtisans, indépendants et petites entreprisesCompatibilité avec plusieurs outils de gestion PMETarification selon la version choisie
QuickBooks ComptabilitéTPE, freelances et petites structures cherchant une solution cloud intuitiveIntégration avec de nombreux outils SaaS et services bancairesAbonnements mensuels selon les besoins
SAP ComptabilitéGrandes entreprises et organisations multisitesIntégration complète avec les modules SAP et autres systèmes métierTarification sur devis pour entreprises
Quadratus ComptabilitéPME et cabinets comptables utilisant l’écosystème CegidIntégration avec d'autres solutions Cegid et outils tiersTarification sur devis selon les fonctionnalités requises
Divalto InfinityPME et ETI recherchant un ERP flexible incluant la comptabilitéIntégration avec les modules Divalto et autres outils métiersTarification sur devis selon les modules et utilisateurs