Dans un contexte où la gestion de la paie devient toujours plus exigeante, entre évolutions légales, multiplicité des conventions collectives et la montée en puissance du cloud/SaaS , le choix du bon logiciel de paie est un enjeu stratégique pour les TPE/PME de 50 salariés et plus. Le logiciel Silae s’impose aujourd’hui comme une référence incontournable en France : il est notamment utilisé par plus de 50 % des cabinets d’expertise‑comptable pour leurs clients bulletins, et détient environ 57 % de parts de marché sur le segment paie des cabinets en 2024. (Source : Payjob)
Pour autant, « solution de référence » ne signifie pas « solution unique pour tous les cas de figure ». Chaque entreprise a ses spécificités : taille, secteur, niveau d’autonomie, système comptable ou SIRH existant. C’est pourquoi il peut être pertinent, pour certaines structures, d’envisager d’autres options logicielles plus alignées avec leur organisation ou leurs ambitions.
Dans cet article, nous vous invitons à explorer les alternatives à Silae adaptées aux TPE et PME, à comparer leurs atouts, leurs profils d’usage, et surtout : à identifier la solution qui correspond à votre contexte métier. En tant qu’intégrateur expérimenté, nous mettons également en lumière les critères de choix essentiels et la manière d’aborder une migration sereinement.
Comparatif élaboré par les experts paie d’Apogea après analyse des principales solutions utilisées en entreprise.
Silae : une solution de référence, mais pas toujours la seule réponse
Le logiciel Silae est aujourd’hui l’une des solutions de paie les plus implantées dans les entreprises françaises, particulièrement dans les TPE, PME et les cabinets comptables. Sa réputation repose sur une combinaison de conformité légale irréprochable, une puissance de paramétrage, et une forte automatisation des processus de paie. C’est une solution de référence, qui a su s’imposer sur un marché exigeant.
Mais comme tout dispositif structurant, son adéquation dépend du contexte de l’entreprise. Silae est particulièrement performant lorsqu’il est intégré dans un écosystème externalisé (via un cabinet ou un intégrateur) ou lorsqu’il est déployé avec accompagnement, en particulier sur des volumes importants. En revanche, certaines structures peuvent avoir des besoins différents : plus d’autonomie, une meilleure lisibilité côté RH, ou une intégration native avec leur comptabilité ou leur SIRH.
Prenons l’exemple d’une PME de 60 à 80 salariés, disposant d’un pôle RH interne et souhaitant piloter la paie en toute autonomie. Si elle utilise déjà Sage pour la comptabilité, s’orienter vers une application comme Sage Business Cloud Paie peut s’avérer plus fluide en matière de connectivité et de prise en main côté RH.

Capture d’écran de l’interface du logiciel de paie Silae
👉 Il ne s’agit donc pas de remplacer Silae par défaut, mais de se poser une question simple : est-ce que la solution actuelle est toujours alignée avec notre organisation, notre niveau d’autonomie souhaité, et notre système d’information global ?
Dans la suite de l’article, nous vous proposons un tour d’horizon de quatre solutions alternatives à Silae, que nous avons sélectionnées pour leur pertinence fonctionnelle, leur fiabilité, et leur compatibilité avec les enjeux concrets des PME.
4 alternatives crédibles à Silae pour les TPE et PME
Toutes les entreprises n’ont pas les mêmes attentes en matière de paie : certaines cherchent un outil simple à prendre en main, d’autres veulent un système capable de gérer des cas complexes, ou encore un environnement RH intégré. Voici une sélection de quatre solutions pertinentes pour les TPE et PME, selon leur taille, leur organisation et leur niveau d’autonomie souhaité.
Sage Business Cloud Paie
Sage Business Cloud Paie est une solution de paie 100 % en ligne, pensée pour les PME qui souhaitent gérer leurs bulletins en interne de manière simple, rapide et conforme.
Avantages
- Accessible directement via un navigateur, sans infrastructure technique à installer.
- Automatisation des traitements de paie courants : édition des bulletins, DSN, calculs de cotisations.
- Interface claire et intuitive, utilisable par un gestionnaire RH non expert en paie.
- Intégration fluide avec Sage Comptabilité pour faciliter le pilotage social et financier.
- Modules RH complémentaires disponibles (congés, absences, entretiens).
Points d’attention
Même si la solution est simple à prendre en main, elle nécessite un paramétrage initial rigoureux pour sécuriser les premiers cycles de paie.
Elle conviendra moins aux structures avec des règles de paie très spécifiques ou des configurations multi-établissements complexes.
Pour qui ?
Sage Business Cloud Paie est idéale pour les PME de 50 à 200 salariés, souhaitant reprendre la main sur la paie en interne, tout en s’appuyant sur un environnement Sage déjà existant (compta, gestion). C’est une solution parfaitement adaptée aux structures qui veulent combiner autonomie, conformité et simplicité.

Interface de la solution Sage Business Cloud Paie
Sage 100 Paie & RH
Sage 100 Paie & RH est une solution de gestion de la paie intégrée à un environnement RH complet, conçue pour les PME plus structurées ou en forte croissance.
Avantages
- Gestion avancée de la paie : multi-établissements, conventions collectives, rétroactivité, primes, gestion des absences.
- Modules RH intégrés : dossiers salariés, entretiens, plannings, tableaux de bord RH.
- Possibilité de déploiement en mode cloud hébergé, pour alléger la charge IT.
- Compatible avec l’écosystème Sage 100 (Comptabilité, Gestion commerciale…).
Points d’attention
Sage 100 Paie & RH demande un projet d’intégration bien cadré, avec formation et accompagnement.
Sa richesse fonctionnelle peut être surdimensionnée pour des structures qui n’ont pas encore structuré leur fonction RH. Le coût et le temps de mise en œuvre doivent donc être bien évalués.
Pour qui ?
Cette solution s’adresse aux PME de 150 à 500 salariés, souvent multi-sites ou avec un besoin d’unifier paie et RH dans un même outil. Elle convient particulièrement aux entreprises ayant un service RH formalisé ou en structuration, et souhaitant professionnaliser leur pilotage social.
Cegid Payroll Ultimate
Cegid Payroll (anciennement Cegid HR Ultimate) est une solution cloud de paie et administration conçue pour les PME et ETI qui ont besoin d’un outil robuste, conforme et capable d’accompagner une structuration croissante de la fonction paie et RH.
Avantages
- Automatisation avancée des cycles de paie : multi‑sociétés, multi‑établissements, conventions collectives, rétroactivité, etc.
- Pilotage de la conformité sociale et fiscale : la solution est pensée pour gérer les échéances et réduire les risques liés aux règles évolutives.
- Cloud et mobilité : accès aux données depuis divers devices, ce qui facilite le travail des gestionnaires paie ou des services RH délocalisés.
- Interface évolutive et intégration possible avec d’autres modules RH, pour envisager une montée en maturité RH/paie.
Points d’attention
Même si la solution est très complète, elle demande un projet de déploiement structuré : paramétrage, formation, accompagnement sont souvent nécessaires pour tirer pleinement parti des capacités.
Le coût et la charge initiale peuvent être plus élevés que pour des outils « paie simple », ce qui la rend moins adaptée si vos besoins restent basiques.
Pour qui ?
Cette solution s’adresse aux entreprises de 150 salariés et plus, voire jusqu’à plusieurs centaines, qui ont un service paie/ RH structuré, ou qui souhaitent faire monter leur niveau de maturité sociale : multi‑établissements, forte variabilité des règles de paie, ou volonté d’unifier paie + RH dans un même outil.
👉 Cegid Payroll est un choix pertinent quand l’enjeu ne se limite pas à « émettre des bulletins », mais devient stratégique pour la gestion et l’évolution de la paie et des ressources humaines.

Capture d’écran de l’interface du logiciel Cegid Payroll Ultimate
Payfit
PayFit est un logiciel de paie en ligne conçu pour les petites entreprises souhaitant gérer leur paie de manière autonome, dans un environnement simple et accessible.
Avantages
- Interface intuitive, accessible même aux non-spécialistes de la paie.
- Automatisation des traitements : bulletins, déclarations sociales, virements.
- Fonctions RH intégrées : gestion des congés, absences, notes de frais, onboarding.
- Démarrage rapide, sans besoin de projet technique lourd.
- Support utilisateur réactif pour les questions courantes.
Points d’attention
La solution est principalement pensée pour des configurations sociales standards. Elle peut être moins adaptée aux entreprises ayant des besoins spécifiques : multi-conventions, modulation du temps de travail, règles sociales complexes.*
L’intégration avec d’autres outils (comptabilité, SIRH tiers) est plus limitée que sur certaines solutions paie orientées PME.
Enfin, le fonctionnement “clé en main” laisse peu de place au paramétrage avancé, ce qui peut limiter la flexibilité dans certains cas.
Pour qui ?
PayFit convient aux entreprises de 20 à 100 salariés avec des profils sociaux homogènes, qui cherchent un outil rapide à prendre en main, centralisant paie et fonctions RH courantes.
C’est une solution pertinente pour des structures en croissance ou en phase de digitalisation, souhaitant automatiser sans alourdir leur organisation.
Comparatif des meilleures alternatives à Silae pour gérer votre paie
| Critères | Sage Business Cloud Paie | Sage 100 Paie & RH | Cegid Payroll | PayFit |
|---|---|---|---|---|
| Mode de déploiement | 100 % cloud | Cloud ou sur site | Cloud natif | Cloud natif |
| Complexité fonctionnelle | Moyenne | Élevée (paie + RH) | Élevée (paie avancée) | Faible à moyenne |
| Niveau d'autonomie | Moyen à élevé | Élevé | Élevé | Très élevé (outil guidé) |
| Adapté à quelle taille ? | 50–200 salariés | 150–500 salariés | 150+ salariés | 20–100 salariés |
| Fonctions RH intégrées | En option | Oui (modules RH natifs) | Oui (RH modulaire) | Oui (de base) |
| Conventions complexes | Géré via paramétrage | Très bien géré | Spécialiste des cas complexes | Limité aux cas standards |
| Intégration comptabilité | Native (Sage Comptabilité) | Native (Sage 100) | Possible avec paramétrage | Plus limitée |
| Temps de mise en œuvre | Rapide (quelques semaines) | Projet structuré (1–2 mois) | Projet structuré (2–3 mois) | Très rapide |
| Type d'organisation ciblée | PME autonomes avec SI Sage | PME avec RH structuré | PME/ETI en croissance | Petites entreprises agiles |
Comment choisir le bon logiciel de paie selon votre structure ?
Choisir une solution de paie n’est pas seulement une affaire de budget ou de fonctionnalités. C’est avant tout une décision structurante qui doit s’aligner avec la réalité de votre organisation : votre mode de gestion, vos contraintes sociales, vos outils existants, et vos ambitions RH à moyen terme.
Voici les critères essentiels à prendre en compte avant de faire un choix :
1. Votre niveau d’autonomie
Souhaitez-vous gérer la paie en interne, ou rester accompagné par un prestataire ?
👉 Si vous voulez reprendre la main, optez pour une solution intuitive, bien documentée, avec un support accessible.
👉 Si vous préférez déléguer tout ou partie de la gestion, choisissez une solution interopérable avec les outils de votre expert-comptable ou intégrateur.
2. La complexité de votre gestion sociale
Souhaitez-vous gérer la paie en interne, ou rester accompagné par un prestataire ?
- Avez-vous plusieurs établissements ou conventions collectives ?
- Gérez-vous des temps partiels, des forfaits jours, du télétravail, ou des heures supplémentaires complexes ?
👉 Des cas comme ceux-là nécessitent un logiciel capable de s’adapter précisément à vos règles de paie.
3. Vos outils existants
Si vous utilisez déjà une solution comptable ou RH (comme Sage, Cegid, ou un SIRH), il est essentiel de choisir une solution compatible pour éviter les doubles saisies et les problèmes d’intégration.
4. La capacité d’évolution de la solution
Votre structure est-elle amenée à grandir ? Allez-vous embaucher, ouvrir d’autres sites, intégrer des processus RH plus formels ?
👉 Privilégiez un outil capable d’évoluer avec vous (par exemple en ajoutant des modules RH plus tard), sans devoir tout changer au bout de 18 mois.
5. L’accompagnement disponible
Un bon logiciel ne suffit pas : la qualité du déploiement, de la formation et du support sont aussi des facteurs déterminants.

Comment choisir le bon logiciel de paie selon votre structure ?
Changer de logiciel de paie peut sembler complexe. Entre la reprise des données, la conformité légale, les échéances déclaratives et la formation des équipes, c’est un sujet qui mérite d’être bien préparé.
En réalité, ce type de projet est tout à fait maîtrisable, à condition d’être encadré par un intégrateur expérimenté. Ce n’est pas uniquement une affaire d’outil, mais surtout d’organisation et d’accompagnement.
Voici les grandes étapes qui sécurisent une migration :
Analyse de votre système actuel : compréhension de votre fonctionnement, conventions collectives, calendrier social, DSN, etc.
Choix de la solution cible adaptée : selon vos priorités (autonomie, intégration, fonctionnalités RH…).
Reprise des données clés : bulletins, salariés actifs, contrats, historiques sociaux, éléments variables.
Phase de paramétrage et de test : pour valider que tout est conforme à vos règles internes.
Formation des utilisateurs : pour garantir une prise en main fluide.
Démarrage sécurisé : parfois avec une double paie pour valider la fiabilité du paramétrage

Conclusion : quelle alternative est faite pour vous ?
Silae reste une solution de référence sur le marché français de la paie. Mais chaque entreprise a sa propre réalité : certains recherchent plus d’autonomie, d’autres veulent un environnement RH unifié, ou une meilleure intégration avec leur comptabilité.
Parmi les alternatives, Sage Business Cloud Paie et la version 100 Paie & RH sont particulièrement bien positionnées pour les TPE/PME souhaitant rester dans cet écosystème. Cegid Payroll s’adresse aux entreprises en structuration avancée, tandis que PayFit peut convenir à des structures agiles avec des besoins standards.
👉 Il n’existe pas de “meilleure solution universelle”, mais bien une solution adaptée à votre fonctionnement, vos outils, et vos objectifs.
FAQ : vos questions fréquentes sur les alternatives à Silae
Pourquoi chercher une alternative à Silae ?
Silae est une solution solide, mais certains profils d’entreprises peuvent avoir des besoins différents : plus d’autonomie, une interface plus accessible, une intégration native avec leur comptabilité, ou des fonctionnalités RH plus développées. L’alternative ne signifie pas « meilleure », mais « mieux adaptée ».
Quel logiciel de paie choisir pour une PME de 50 à 200 salariés ?
Tout dépend de votre niveau d’autonomie, de vos outils existants et de la structuration RH. L’offre cloud de l’éditeur Sage convient bien aux PME recherchant simplicité et intégration. Sa version 100 ou la solution Cegid sont plus adaptées aux organisations complexes ou multi-sites.
Peut-on conserver son historique lors d’un changement d’outil ?
Oui. Il est possible de reprendre les données essentielles (salariés, contrats, bulletins, DSN, etc.), à condition de bien planifier la migration et de travailler avec un prestataire expérimenté..
Une solution paie inclut-elle toujours des fonctions RH ?
Non. Certains outils intègrent des fonctions RH (absences, entretiens, notes de frais…), d’autres se concentrent uniquement sur la paie. Il est important de clarifier vos besoins dès le départ pour choisir une solution complète ou modulaire.
Une solution paie inclut-elle toujours des fonctions RH ?
Non. Certains outils intègrent des fonctions RH (absences, entretiens, notes de frais…), d’autres se concentrent uniquement sur la paie. Il est important de clarifier vos besoins dès le départ pour choisir une solution complète ou modulaire.


